Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp38Q8BW70 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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