Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms