Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc2Q8BKV1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms