Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Pum3Q8BKS9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pum3Q8BKS9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pum3Q8BKS9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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