Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp1Q8BJQ2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp1Q8BJQ2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp1Q8BJQ2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp1Q8BJQ2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms