Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms