Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms