Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms