Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms