Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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