Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Amigo1Q80ZD8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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