Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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