Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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