Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NischQ80TM9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms