Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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