Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms