Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms