Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms