Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed3Q78IS1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms