Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rph3alQ768S4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms