Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms