Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms