Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms