Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms