Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt39Q6IFX4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms