Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms