Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms