Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc3Q64519 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sdc3Q64519 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sdc3Q64519 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sdc3Q64519 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc3Q64519 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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