Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms