Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Phc1Q64028 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Phc1Q64028 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Phc1Q64028 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc1Q64028 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phc1Q64028 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phc1Q64028 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phc1Q64028 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phc1Q64028 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Phc1Q64028 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phc1Q64028 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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