Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms