Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms