Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms