Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms