Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms