Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ripk1Q60855 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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