Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms