Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb6Q60692 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms