Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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