Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CttnQ60598 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CttnQ60598 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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