Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3aQ60520 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sin3aQ60520 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms