Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms