Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r196Q5SVD5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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