Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms