Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms