Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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