Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms