Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Fam220aQ3ZN08 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Fam220aQ3ZN08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam220aQ3ZN08 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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