Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc185Q3V118 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc185Q3V118 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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