Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim80Q3V061 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim80Q3V061 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim80Q3V061 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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